合同是现代商业交易的主要载体。理想状态下的税收筹划应该从合同开始。比如很多企业在转让房地产等资产时，会采用股权转让的方式来减少流转税和土地增值税。

在税法中，资产收购是什么，股票收购是什么，没有统一规范的定义，参考《关于企业重组经营企业所得税处理若干问题的通知》(财税[2009]59号)(以下简称财税[2009]59号)，资产收购是指企业购买另一家企业实质性经营资产的交易。股权收购是指企业购买另一家企业的股权，实现对被收购企业的控制交易。本文从财税[2009]59号文分析，资产转让与股权转让是两种不同的法律行为，其主要区别在于：1)转让的目的不同。资产转让的目标是目标公司的实质经营资产，股权转让的目标是目标公司的股权。(2)转让方是目标公司，股权转让方是目标公司，股权转让方是目标公司的原股东。(3)转让程序不同。(3)不涉及目标公司的股东变更程序；不涉及目标公司的股东变更程序。

举例来说，在进行营业改革之前，我们接触过的一个企业咨询案例中，在转让所租林地的树木时，由于合同中没有明确界定森林资源和活立木的转让目标，而同时被税务局和地方税务局征收增值税和营业税，因此后续行动十分被动。

例如，在科技企业规划研发费用加计扣除的过程中，研发费用辅助帐已经成为必要条件。国家税务总局发〔2015〕119号文规定，对享受加计扣除的研发费用按研发项目设置辅助帐，准确归集当年可加计扣除的各项研发费用的实际发生额。新规则从以前要求企业必须对研发费用进行专帐管理改为按研发项目设置辅助帐，按研发项目设置辅助帐，减轻了企业的会计负担，但对未建立研发费用辅助帐的企业来说，这是一个巨大的挑战。